เริ่มจากงานนี้เป็นการร่วมมือกันอีกครั้งของ สหมงคลฟิล์มอินเตอร์เนชั่นแนล และ ภาพยนตร์หรรษา โดย ปืนใหญ่จอมสลัด เป็นภาพยนตร์แอ็คชั่นแฟนตาซีอิงประวัติศาสตร์ มีเรื่องราวอยู่บนพื้นฐานของเรื่องจริงที่เกี่ยวข้องกับ รัฐปัตตานี ในอดีต ซึ่งปกครองโดยราชินี 3 พระองค์ และสอดคล้องกับเรื่องราวประวัติความเป็นมาของปืนใหญ่พญาตาณี ที่ปัจจุบันตั้งอยู่บริเวณหน้ากระทรวงกลาโหม

ด้านทีมงานนั้นก็ล้วนแล้วแต่เป็นมือดีของวงการแทบทั้งสิ้น บทภาพยนตร์นั้นได้ วินทร์ เลียววาริน นักเขียนรางวัลซีไรซ์ และ คงเดช จาตุรันต์รัศมี หนึ่งในมือเขียนบทอันดับต้นๆ ของเมืองไทยมาร่วมมือกัน งานออกแบบงานสร้างก็เป็นหน้าที่ของ เอก เอี่ยมชื่น ดูแลการผลิตโดย เชิดพงษ์ เหล่ายนตร์ และ ชาญกิจ ชำนิวิกัยพงศ์  ทำหน้าที่เป็นที่ปรึกษาดูแลงานทางด้านภาพ

ส่วนความอลังการงานสร้างของฉากต่างๆ นั้น ก็ล้วนแล้วแต่ต้องมีการออกแบบทำกันใหม่แทบทั้งสิ้น เพื่อให้จินตนาการของผู้กำกับและทีมงานเกิดขึ้นได้จริง โดยมีการวางโลเกชั่นที่จะใช้ถ่ายทำไว้หลายแห่ง อาทิ ฉากหมู่บ้านชาวเล จะยกกองไปปักหลักถ่ายทำกันที่เกาะสีชัง จ.ชลบุรี, โลเกชั่นใน อ.สัตหีบ ก็จะใช้ถ่ายทำเรื่องราวในส่วนกลางทะเลและกำแพงวัง, ที่กระบี่และพังงา จะใช้ถ่ายทำฉากถ้ำในเกาะเมราห์ (หรืออีกาดำเดิม)  และก็ยังมีการสร้างฉากใหญ่ในส่วนสำคัญของหนังอีกหลายฉาก อาทิ ห้องของเจ้าชายราไว, การสู้รบบนเรือโจรสลัด และฉากภายในพระราชวัง

อีกส่วนสำคัญที่ทำให้หนังเรื่องนี้น่าสนใจก็คือ เป็นการระดมนักแสดงดังระดับฝีมือของเมืองไทย เริ่มจากพระเอกยอดนิยม ติ๊ก เจษฎาภรณ์  ผลดี, การประชันฝีมือกันของ อนันดา เอเวอร์ริ่งแฮม ที่ในเรื่องมีวิชาดูหลำ วิชาของพวกชาวน้ำ ซึ่งต้องถ่ายทอดโดยเทคนิกด้านภาพให้ออกมาในลักษณะของความเป็นแฟนตาซี ส่วนคู่ปรับอย่าง เดี่ยว ชูพงษ์ ช่างปรุง นั้น จะมีความสามารถเป็นเลิศในด้านการต่อสู้ ด้านนักแสดงฝ่ายหญิงนั้นได้นางเอกใหม่ แอนนา แฮมบาวรีส (ที่รับบทคู่กับ อนันดา), มนัสนันท์ พัชรโสภาชัย ( น้ำเพชร ) เล่นเป็น ลิ้มกอเหนี่ยว,  Jacqueline (Jacky) เล่นเป็น บิรู ,เมสิณี แก้วราตรี (เมย์) เล่นเป็น บินตัง ร่วมด้วย จารุณี สุขสวัสดิ์, สรพงศ์ ชาตรี, อรรถพร ธีมากร, ศุภกรณ์ กิจสุวรรณ, วินัย ไกรบุตร, พิมพ์พรรณ ชลายนคุปต์, สุวินิต ปัญจมะวัต, จักรกฤษณ์ พาณิชย์ผาติกรรม, เอก โอรี และอีกดาราร่วมแสดงอีกมากมาย

ด้านเนื้อเรื่องนั้นจะเล่าย้อนไปเมื่อ 400 ปีที่แล้ว เมื่อ ลังกาสุกะ รัฐอิสระต้องสูญเสีย รายาบาฮาดูร์ ชาห์ จากการถูกลอบปลงพระชนม์ ราชวงศ์ไม่มีทางเลือกอื่น นอกจากการสถาปนา องค์หญิงฮีเจา ธิดาคนโตขึ้นเป็นรายาสตรีองค์แรก แห่งลังกาสุกะ แม้รายาฮีเจาจะปกป้องบ้านเมืองอย่างเข้มแข็ง แต่เหล่าแคว้นรอบด้าน รวมทั้งกลุ่มกบฏและโจรสลัดต่างๆ ล้วนหมายจะยึดครองดินแดนอันมั่งคั่งแห่งนี้ จนยานิส บรี ปราชญ์แห่งอาวุธชาวดัชท์ เดินทางมาพร้อมกับศิษย์เอกนักประดิษฐ์ชาวจีนนาม ลิ่มเคี่ยม เพื่อนำมหาปืนใหญ่ อาวุธที่ดีที่สุดไปถวายรายาฮีเจาใช้ป้องกันบ้านเมือง แต่กลับถูกกลุ่มโจรสลัดที่นำโดย เจ้าชายราไว และ อีกาดำ จอมสลัดผู้มีวิชาดูหลำอันแก่กล้า ซุ่มโจมตีเพื่อชิงมหาปืนใหญ่ จนทำให้เรือฮอลันดาระเบิด ยานิส บรี ถึงแก่ความตาย กระบอกปืนใหญ่จมลงสู่ก้นทะเล เหลือเพียงแต่ ลิ่มเคี่ยม เท่านั้นที่ยังรอดชีวิตอยู่

แต่เหตุการณ์นั้นยังเป็นเวลากำเนิดของ ปารี เด็กชายชาวเลผู้มีคุณสมบัติพิเศษในตัว ที่จะสามารถฝึกวิชาดูหลำขั้นสูงได้ ปารีเติบโตขึ้นจนเป็นหนุ่ม พร้อมกับสั่งสมทั้งความสามารถและความแค้น ในการสะสาง อีกาดำ ที่ทำให้พ่อและแม่ของตนต้องตาย ลิ่มเคี่ยมซึ่งช่วยชีวิต ปาร ีในครั้งนั้นไว้ได้ หลบมาใช้ชีวิตอยู่กับหมู่บ้านชาวเล พร้อมประดิษฐ์อาวุธพิสดารมากมาย และตั้งกลุ่มก่อกวนตัดกำลังโจรสลัดขึ้น

ทางด้านกลุ่มโจรสลัด ยังคงคอยโจมตีลังกาสุกะเรื่อยมา และคิดการใหญ่ในการรวบรวมกลุ่มสลัด น้อยใหญ่ในแคว้นนํ้า เพื่อบุกยึดครองลังกาสุกะ และยังคงคิดจะกู้มหาปืนใหญ่มาครอบครองไว้ แม้ลังกาสุกะจะมีทหารเอกฝีมือเยี่ยมอย่าง ยะรัง แต่ ฮีเจา ก็ยังจำเป็นต้องให้ อูงู น้องสาวคนเล็กของตนอภิเษกกับ เจ้าชายจากปาหัง เพื่อเพิ่มความเข้มแข็งให้ลังกาสุกะ แม้ อูง ูจะไม่เต็มใจก็ตาม ขณะที่ ยะรังนั้นกลับตกหลุมรัก บิรู องค์หญิงคนรอง แต่กลับไม่สามารถเปิดเผยความรู้สึกนั้นได้

การต่อสู้ของหลายฝ่ายเริ่มขึ้น จนทำให้ ปารี ได้มาพบกับ อูงู ทั้งคู่หลงไปติดเกาะร้างแห่งหนึ่ง เพื่อรักษาตัวจากบาดแผล ที่นั่น ปารี ได้ฝึกวิชาดูหลำชั้นสูงจาก อาจารย์กระเบนขาว ปรมาจารย์ทางดูหลำ และค้นพบว่า ดูหลำคือวิชาที่มีทั้งด้านสว่างที่ทรงพลังและด้านมืดที่น่ากลัว ยากจะควบคุมจิตใจเอาไว้ได้ พร้อมกับที่ความรักของทั้ง ปารี และ อูงู ได้งอกเงยขึ้น ขณะเดียวกัน ลิ่มเคี่ยม กุญแจสำคัญในการสร้างปืนใหญ่ กลับถูกกลุ่มสลัดจับตัวเป็นเชลยไว้ได้ และถูกบังคับให้ต้องสร้างปืนใหญ่ ที่จะนำมาใช้ทำลายล้างลังกาสุกะ

สงครามครั้งใหญ่กำลังจะเริ่มขึ้น โดยลังกาสุกะตกเป็นฝ่ายเสียเปรียบ เพราะกองทัพโจรสลัด กลับสามารถกู้มหาปืนใหญ่ในตำนานนั้นจากก้นทะเลไว้ได้ ลังกาสุกะเป็นเป้าหมายของการทำลายล้าง มีเพียง ยะรัง นักรบผู้กล้า ปัญญาของ ลิ่มเคี่ยม อูงู ผู้พร้อมสละทั้งชีวิตและความรักเพื่อแผ่นดิน และพลังดูหลำอันลึกลับของ ปารี เท่านั้น ที่จะต่อกรกับแสนยานุภาพจากกองทัพของโจรสลัดเอาไว้ได้